Comme sur Paris-Nice, en mars dernier, et sur le prochain Tour de France, le contre-la-montre par équipes s'est disputé sous le format du meilleur temps de chaque équipe enregistré sur le premier coureur arrivé. L'Américain Matteo Jorgenson a ainsi été lancé par ses équipiers dans la côte finale de 800 mètres à plus de 6% de moyenne pour glaner cette victoire collective. Un succès auquel Wout van Aert n'a pu apporter qu'une aide limitée, lâchant prise après seulement sept minutes d'effort.

Deuxième à 9 secondes, Netcompany-INEOS a manqué de peu le maillot jaune pour le Français Kévin Vauquelin, qui a franchi la ligne juste devant son équipier britannique Oscar Onley. En effet, EF Education-EasyPost, la formation du leader du classement général Alex Baudin, s'est battue pour terminer en troisième place, à 29 secondes de l'équipe victorieuse. Le Français, lauréat de la première étape, garde ainsi 12 secondes d'avance sur Vauquelin et Onley.

Lidl-Trek, avec Mattias Skjelmose et Juan Ayuso, a terminé quatrième à 40 secondes de Visma-Lease a Bike, alors que Decathlon-CMA CGM de Paul Seixas a conclu à 45 secondes. Cian Uijtdebroeks, à la tête de Movistar, s'est classé septième à 52 secondes. UAE Team Emirates-XRG, mené par Isaac Del Toro, a fait la mauvaise opération du jour, en neuvième place, à plus d'une minute de Visma-Lease a Bike.

La quatrième étape, vallonnée, reliera mercredi Le Puy-en-Velay et Montrond-les-Bains, sur 167,4 kilomètres.